Entschlüsselung der humanen FSGS auf Einzelzellebene

Die FSGS-Forschung wurde bisher durch den Mangel an gut untersuchten Patientengruppen und begrenzte Methoden zur Probenuntersuchung limitiert. Im Rahmen von STOP-FSGS haben wir nun Zugang zu umfassenden klinischen Kohorten, wie dem deutschen FOrMe-Register (https://forme-register.de/), dem Hamburger GN-Register (https://www.sfb1192.de/de/register) und der neu etablierten HERO-Biobank (https://hckh.org/kidney-registries/hero).

Das Hauptziel dieses Teilprojekts ist die Entschlüsselung der humanen FSGS auf einzelzellulärer Ebene, indem wir neueste Technologien kombinieren, um so eine umfassende molekulare Karte der humanen FSGS zu erstellen.

Um die durch FSGS vermittelten Veränderungen in der Genexpression in den verschiedenen Nierenzellen zu erkunden und Signalwege und Zell-Zell-Interaktionen zu identifizieren, wollen wir Einzelzell-RNA-Sequenzierungen an Biopsien von FSGS- Patient:innen und gesunden Kontrollen durchführen. Die daraus resultierenden Ergebnisse werden wir dann mit Hilfe der sogenannten Multiplex-Bildgebung, mit der wir mehr als 60 Proteine im selben Gewebestück sichtbar machen können, darstellen. Mit dieser Gewebekarte wollen wir zelluläre Veränderungen in der FSGS und korrelierenden klinischen Ergebnissen identifizieren. Mit Hilfe fortschrittlicher Bildanalysen werden wir zusätzlich strukturelle und molekulare Daten integrieren, um so Unterschiede zwischen Patientengruppen mit unterschiedlichen klinischen Verläufen zu untersuchen und eine molekulare Karte von FSGS zu erstellen, die in Zukunft bei der Klassifizierung (z.B. Schweregrad und klinische Ergebnisse, Ansprechen auf bestimmte Therapien) von FSGS- Patient:innen helfen kann.

Zusätzlich wollen wir einen zentralen Anlaufpunkt für Informationen, Datenanfragen und Harmonisierung einführen, um zum einen den Austausch von Informationen zwischen den Mitgliedern des Konsortiums, externen Kooperationspartnern sowie Patient:innen und ihren Vertreter:innen zu erleichtern und zum anderen die Stratifizierung von Patient:innen für klinische Studien zu erleichtern.